La Junta de Comunidades de Castilla-La Mancha, a través de su Plan de Conservación del Medio Natural, ha establecido como prioridad la restauración de hábitats naturales, la protección del agua y el suelo, y la conservación de la vida silvestre y los espacios naturales protegidos. Estas líneas de actuación reflejan un compromiso firme con la sostenibilidad y la biodiversidad, y requieren de una colaboración estrecha con el Gobierno de España para garantizar su eficacia. En este marco, resulta imprescindible insistir en la recuperación y conservación de riberas y arroyos, así como en el refuerzo de la protección de humedales, que son ecosistemas clave para la regulación hídrica, la mitigación del cambio climático y la preservación de especies amenazadas
A principios de febrero de 2025 la consejera de Desarrollo Sostenible se reunió con el presidente de la Confederación Hidrográfica del Ebro (CHE) para abordar actuaciones de limpieza del cauce y mantenimiento de márgenes del río Mesa a su paso por los municipios del Valle del Mesa, situados en la comarca del Señorío de Molina (Guadalajara) y cómo estudiar posibles soluciones a los desbordamientos que se producen reiteradamente.
El Gobierno regional entiende que es fundamental que las administraciones colaboren para garantizar una repuesta eficaz en las zonas afectadas por fenómenos meteorológicos adversos, y ha instado a la confederación hidrográfica del Ebro a que realice las actuaciones de limpieza en el cauce a la altura del municipio de La Yunta (Guadalajara). Además también han sido planificadas las de Villel de Mesa, Mochales y Argal de Mesa, donde se va a proceder a la retirada de los residuos y la maleza en el cauce del río, así como al mantenimiento de márgenes. La consejera ha insistido en la urgencia en la actuación a la CHE.
Asimismo, siguiendo las instrucciones dictadas en la resolución de las Cortes de Castilla-La Mancha de fecha 17 de marzo de 2025, que instaba al Gobierno regional a solicitar a las Confederaciones Hidrográficas el mantenimiento adecuado de los cauces de ríos y arroyos en los tramos no urbanos, y que regularizase su limpieza a través de un plan continuado, desde la consejería de Desarrollo Sostenible se enviaron cartas a las Confederaciones Hidrográficas de Duero, Ebro, Guadalquivir, Guadiana, Júcar, Segura y Tajo, haciéndoles llegar dicha resolución y poniéndose a su disposición para colaborar estrechamente y garantizar que las localidades se sientan atendidas.
Del mismo modo se procedió con la resolución de las Cortes de Castilla-La Mancha de fecha 10 de abril de 2025.
Por otro lado, en julio de 2025 el Gobierno regional presenta la restauración de la laguna de Uña, que ha acometido.
En julio de 2026, se visita la instalación en la Reserva Natural Laguna Salada de Pétrola de un filtro verde para garantizar la calidad del agua del humedal, que cuenta con una importante comunidad de aves acuáticas, entre las que destaca el flamenco. En esta actuación se han invertido más de medio millón de euros. El Ejecutivo autonómico ha destinado en los últimos años un total de 6,5 millones de euros en actuaciones de restauración en los humedales de toda la región, a las que se da continuidad participando en el proyecto LIFE Humedales, que cuenta con 7,6 millones de euros para Castilla-La Mancha para un periodo de diez años, con tres millones que aporta el Gobierno regional y el resto viene del Estado y la Comunidad Europea.