El Gobierno Regional ha mantenido contactos con el Ministerio de Fomento para mejorar el transporte en las zonas del Corredor del Henares y Comarca de la Sagra.
En este sentido, se remitieron sendas cartas al Ministerio de Fomento en los meses de enero y junio de 2016 con objeto de trasladar propuestas para la mejora del servicio de cercanías de Madrid en la línea C-2 Guadalajara-Chamartín y ampliar los servicios directos CIVIS. Los CIVIS son trenes que circulan en horarios específicos en horas punta de mañana y tarde, y que solo paran en determinadas estaciones de algunas líneas de Cercanías con el fin de reducir los tiempos de viaje y optimizar el servicio. En el caso concreto de la línea C2, el CIVIS sólo para en Guadalajara – Alcalá de Henares – Torrejón – Chamartín. Gracias a las reivindicaciones del Gobierno Regional desde el pasado 11 de abril de 2016, el Ministerio de Fomento amplió los servicios directos CIVIS, añadiendo un nuevo tren con salida a las 6:55 de Guadalajara en dirección Chamartín. De esta manera, se han incrementado de tres a cuatro servicios CIVIS con destino Madrid en hora punta, manteniéndose los siete servicios con origen en Chamartín y destino Guadalajara en las horas semipuntas de la tarde. Por otro lado, se ha conseguido mantener los servicios CIVIS en los periodos vacacionales de verano y navidades, con una oferta de cuatro servicios con destino Madrid y seis con destino Guadalajara. El tiempo de viaje se ha visto reducido con el nuevo esquema entre 10 y 25 minutos.
En la reunión celebrada en diciembre de 2016 entre el Presidente de Castilla-La Mancha y el Ministro de Fomento del Gobierno de España se volvieron a plantear estos asuntos.
Y en junio de 2018, se presentó una proposición no de ley en las Cortes regionales instando al Gobierno de España a implicarse en la ampliación de la línea C-5 (Móstoles-El Soto, Atocha, Humanes) hasta Illescas y la Sagra y que la misma se incluya en los nuevos planes de infraestructuras de los presupuestos generales; a que ponga en marcha de manera urgente trenes lanzadera para buscar una solución momentánea al problema; a que realice las inversiones y obras necesarias para habilitar el tren de cercanías para Illescas y la Sagra; así como a realizar la inversión necesaria para la reapertura de la estación de Seseña.